Компьютерная программа PASS

Компьютерная программа PASS была разработана В. Поройковым и Д. Филимоновым. В ней используется язык описания структур, который еще в 1972 году предложил советский ученый В. Авидон. PASS успешно генерирует спектр биологических активностей органических соединений, и ее предсказательная сила возрастает по мере расширения набора соединений, использованного для построения корреляций (так называемой обучающей выборки). Разумеется, этот метод не позволяет ни обнаружить, ни сконструировать соединение с активностью, которой нет в обучающей выборке, однако в некоторых случаях он очень полезен.

Компьютерную программу PASS использовали для предсказания биологической активности одного из противоэпилептических препаратов. Длина горизонтальных белых линий отражает прогнозируемую вероятность того или иного действия на организм (их рассматривается около сотни). Наиболее вероятна противоэпилептическая активность, но это вещество, возможно, является также канцерогеном и тератогеном.

Возможность предсказывать разные активности, используя общий язык описания структур, имеет глубокий физический смысл. Дело в том, что низкомолекулярные биологически активные соединения, используемые для нахождения корреляций, взаимодействуют со своими рецепторами сходным образом, с помощью одних и тех же структурных элементов. Это, если вдуматься, неудивительно, ибо почти все рецепторы имеют белковую природу, и взаимодействие с ними описывается стандартным набором: водородное связывание, электростатика (ион-ион, ион-диполь, диполь-диполь) и контакты гидрофобных остатков.